É crescente o interesse pelo conhecimento sobre a diversidade, modo de acção e relevância dos microrganismos nos mais diversos campos da vida quotidiana. As preocupações com as doenças infecciosas emergentes ou a variedade de produtos alimentares incluindo preparações microbianas, são expressões visíveis desse interesse. A Microbiologia é uma área em que o conhecimento fundamental está em expansão determinando o desenvolvimento de aplicações muitas delas incorporando uma grande componente de inovação tecnológica.

Neste contexto, é essencial a formação de especialistas em Microbiologia que possam desempenhar funções como investigadores ou como técnicos de laboratório. A formação destes especialistas deve percorrer os diversos domínios em que o impacto e acção de microrganismos são hoje reconhecidos como relevante: o ambiente, os alimentos ou a saúde humana. A formação em Microbiologia deve ainda ter em conta a panóplia de metodologias analíticas hoje disponíveis e as possibilidades de aplicação do conhecimento em processos biotecnológicos.

Esta é, portanto, uma área em que as economias nacional e europeia irão ter uma necessidade crescente de quadros, seja trabalhando por conta de outrem (em organizações governamentais, intergovernamentais, ONGs, indústrias, hospitais, etc), seja criando empresas de prestação de serviços ou actividades de consultadoria. Considera-se, portanto, que uma formação de segundo ciclo deve dar alguns conceitos e competências mínimas na área do Empreendedorismo.